上一季结尾全员被抓入神秘实验室，第二季他们发现自己的超能力正在被武器化。
第一季结尾，拥有不同超能力的天才少年们被“伊甸园基金会”抓捕。第二季开场，他们被关在海底实验室，每天接受各种测试。队长夏天发现，基金会正在提取他们的能力基因，注入到雇佣兵体内，制造可操控的超能士兵。更可怕的是，基金会手里有一颗能瞬间引爆全球超能力者脑中芯片的“王炸”。少年们必须在能力被抽干之前逃出去，并摧毁控制芯片的母系统。他们内部出现分歧：有人想逃，有人想毁掉所有超能力让自己变回正常人。而基金会负责看管他们的科学家，竟然是夏天失踪多年的父亲。父与子、自由与控制之间的终极对决，在海底展开。
相比第一季全面升级，世界观更加黑暗宏大。每个少年都获得了立体的人物弧光，尤其是反派的塑造令人惊喜。动作场面和智斗戏份分配合理，结尾留有巨大悬念，第三季快来吧。
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